耐荫树种，喜阴湿环境。喜温暖湿润的气候[1]。自然生长在山谷、溪边、缓坡腐殖质丰富的酸性土壤中，中性土、钙质土也能生长。耐干旱瘠薄，不耐低洼积水。很少有病虫害，生长缓慢，寿命长。
南方红豆杉是中国亚热带至暖温带特有成分之一，在阔叶林中常有分布。喜生于山脚腹地较为潮湿处。对气候适应力较强，年均温11—16℃，最低极值可达—11℃，耐阴湿力强，要求肥力较高的黄壤，黄棕壤(酸性，微酸性土壤)，较能耐水湿，南方红豆杉具有较强的萌芽能力，树干上多见萌芽小枝，但生长比较缓慢。
南方红豆杉枝叶浓郁，树形优美，种子成熟时果实满枝逗人喜爱。适合在庭园一角孤植点缀，亦可在建筑背阴面的门庭或路口对植，山坡、草坪边缘、池边、片林边缘丛植。宜在风景区作中、下层树种与各种针阔叶树种配置。国外用欧洲豆杉作整形绿篱效果很好。
国家二级保护植物，为优良珍贵树种。材质坚硬，刀斧难入，有“千枞万杉，当不得红榧一枝桠”的俗话。边材黄白色，心材赤红，质坚硬，纹理致密，形象美观，不翘不裂，耐腐力强。可供建筑、高级家具、室内装修、车辆、铅笔杆等用。种子含油量较高，是驱蛔、消积食的珍稀药材。
种子繁殖
种子在10月份成熟，及时采收后放在水与细沙的混合液中（水沙比2∶1）。将种子在洗衣板上揉搓，除去种子外皮，磨损坚硬的肉种皮。选择背阴干燥不积水地块、挖坑，与湿河沙按1∶2比例混合贮藏在坑内。次年3月取出净种，用50度白酒和40℃温水（1∶1）浸泡20分钟，捞出后用浓度为0.05%九二○浸种20～24小时，以打破休眠提高出苗率。3月底移入温室催芽，温度要求20～25℃，待有种子“露白”时即可点播。
播种及移植
将畦做成1m宽、长适宜。将种子播在畦内覆土2.5厘米，浇透水复膜。也可将发芽种子点播在盖有地膜的畦内，行距20厘米、株距10厘米。一般20～30天即可出苗，当幼苗长3～4片叶时，选阴天间苗移植，行距20厘米、株距10厘米。种植后浇水、中耕、除草促长。由于红豆杉生长缓慢，最怕强光，适当遮荫有利成长。一般当年生苗可达10～15厘米，最高可达20厘米,2年生苗50～90厘米，4年生苗高1.5～2米。
每年5～6月份剪取当年半木质化枝作插条，母树选择10年以下树龄。长度15～20厘米，剪去下部小枝、针叶剪成马蹄形，放在ABT 7号生根粉中浸泡，浓度为30×10-6～50×10-6，浸泡时间3～12小时。随后将插条插在基质为河沙的苗床上。苗床要求1米宽，长度适宜，扦插深度3～5厘米。行株距10cm×8cm，随即喷水。苗床上搭架，用塑料布覆盖，每日喷水2～3次，半月后每日喷水1次。一般地温保持20～30℃，不要强光照射，30～40天即可生根。在此期间，可喷施芸苔素等叶面肥，促进生长。
当幼苗生根后，精细管理促进旺长，并适当通风透光炼苗，增加抗逆性。炼苗结束后可移栽在大苗床上。
幼苗一般在苗床生长2～3年，每年定时喷生长素、叶面肥精心管理。当苗高50～100厘米时即可上山造林成片栽种。栽植时间为秋末或春季均可，株行距可按3米×4米，亦可在街道、公园、作观赏树栽。
